Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms