Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casp1P29452 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casp1P29452 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casp1P29452 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casp1P29452 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Casp1P29452 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casp1P29452 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Casp1P29452 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casp1P29452 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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