Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms