Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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