Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apex1P28352 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms