Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Defa5P28312 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Defa5P28312 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Defa5P28312 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Defa5P28312 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Defa5P28312 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa5P28312 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Defa5P28312 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms