Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
H2-DMaP28078 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
H2-DMaP28078 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
H2-DMaP28078 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-DMaP28078 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-DMaP28078 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-DMaP28078 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms