Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb9P28076 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms