Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vav1P27870 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vav1P27870 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms