Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms