Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms