Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms