Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms