Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja1P23242 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja1P23242 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja1P23242 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja1P23242 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms