Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx3P23198 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx3P23198 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx3P23198 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx3P23198 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx3P23198 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx3P23198 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx3P23198 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cbx3P23198 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx3P23198 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx3P23198 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx3P23198 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx3P23198 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx3P23198 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx3P23198 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx3P23198 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx3P23198 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx3P23198 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx3P23198 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx3P23198 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx3P23198 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx3P23198 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx3P23198 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx3P23198 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx3P23198 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx3P23198 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx3P23198 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx3P23198 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx3P23198 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx3P23198 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx3P23198 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx3P23198 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx3P23198 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx3P23198 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cbx3P23198 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx3P23198 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms