Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RarbP22605 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RarbP22605 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RarbP22605 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RarbP22605 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RarbP22605 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RarbP22605 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RarbP22605 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RarbP22605 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RarbP22605 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RarbP22605 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RarbP22605 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RarbP22605 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RarbP22605 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RarbP22605 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RarbP22605 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RarbP22605 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RarbP22605 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RarbP22605 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RarbP22605 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RarbP22605 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RarbP22605 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RarbP22605 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RarbP22605 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RarbP22605 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RarbP22605 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RarbP22605 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RarbP22605 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RarbP22605 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RarbP22605 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RarbP22605 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RarbP22605 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RarbP22605 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RarbP22605 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RarbP22605 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RarbP22605 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RarbP22605 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RarbP22605 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RarbP22605 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RarbP22605 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RarbP22605 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RarbP22605 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RarbP22605 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RarbP22605 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RarbP22605 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RarbP22605 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RarbP22605 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RarbP22605 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RarbP22605 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RarbP22605 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RarbP22605 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RarbP22605 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RarbP22605 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RarbP22605 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RarbP22605 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RarbP22605 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RarbP22605 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RarbP22605 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RarbP22605 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RarbP22605 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RarbP22605 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RarbP22605 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RarbP22605 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RarbP22605 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RarbP22605 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RarbP22605 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RarbP22605 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RarbP22605 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RarbP22605 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RarbP22605 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RarbP22605 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RarbP22605 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RarbP22605 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RarbP22605 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RarbP22605 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RarbP22605 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RarbP22605 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RarbP22605 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RarbP22605 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RarbP22605 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RarbP22605 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RarbP22605 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RarbP22605 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RarbP22605 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms