Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpcP21841 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpcP21841 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpcP21841 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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