Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lmnb2P21619 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmnb2P21619 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmnb2P21619 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmnb2P21619 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmnb2P21619 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmnb2P21619 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmnb2P21619 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmnb2P21619 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.2 ms