Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc2P20801 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms