Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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