Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NefhP19246 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NefhP19246 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NefhP19246 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NefhP19246 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NefhP19246 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NefhP19246 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NefhP19246 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NefhP19246 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NefhP19246 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NefhP19246 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NefhP19246 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NefhP19246 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NefhP19246 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NefhP19246 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NefhP19246 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NefhP19246 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NefhP19246 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NefhP19246 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NefhP19246 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NefhP19246 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NefhP19246 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NefhP19246 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NefhP19246 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NefhP19246 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NefhP19246 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NefhP19246 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NefhP19246 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NefhP19246 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NefhP19246 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NefhP19246 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NefhP19246 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NefhP19246 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NefhP19246 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NefhP19246 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NefhP19246 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NefhP19246 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NefhP19246 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NefhP19246 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NefhP19246 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NefhP19246 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NefhP19246 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NefhP19246 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NefhP19246 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NefhP19246 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NefhP19246 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NefhP19246 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NefhP19246 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NefhP19246 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NefhP19246 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NefhP19246 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NefhP19246 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NefhP19246 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NefhP19246 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NefhP19246 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NefhP19246 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NefhP19246 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NefhP19246 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NefhP19246 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NefhP19246 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NefhP19246 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NefhP19246 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NefhP19246 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NefhP19246 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms