Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csn1s1P19228 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csn1s1P19228 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms