Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms