Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms