Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18530 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18530 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18530 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18530 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
P18530 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
P18530 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P18530 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18530 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18530 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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