Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18528 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18528 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18528 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18528 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18528 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18528 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18528 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18528 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
P18528 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18528 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18528 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18528 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18528 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
P18528 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18528 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18528 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
P18528 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18528 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18528 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18528 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18528 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18528 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18528 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18528 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18528 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18528 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18528 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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