Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsdP18242 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsdP18242 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsdP18242 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsdP18242 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsdP18242 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsdP18242 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsdP18242 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsdP18242 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsdP18242 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsdP18242 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsdP18242 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsdP18242 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsdP18242 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsdP18242 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsdP18242 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsdP18242 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsdP18242 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsdP18242 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsdP18242 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsdP18242 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsdP18242 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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