Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms