Protein–RNA interactions for Protein: P16092

Fgfr1, Fibroblast growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1P16092 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fgfr1P16092 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms