Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rag1P15919 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rag1P15919 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms