Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30aP15533 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30aP15533 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms