Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SptbP15508 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SptbP15508 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SptbP15508 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SptbP15508 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SptbP15508 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SptbP15508 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SptbP15508 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SptbP15508 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SptbP15508 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SptbP15508 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SptbP15508 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SptbP15508 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SptbP15508 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SptbP15508 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SptbP15508 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SptbP15508 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SptbP15508 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SptbP15508 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SptbP15508 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SptbP15508 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SptbP15508 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SptbP15508 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SptbP15508 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SptbP15508 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SptbP15508 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SptbP15508 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SptbP15508 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SptbP15508 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SptbP15508 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SptbP15508 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SptbP15508 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SptbP15508 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SptbP15508 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SptbP15508 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SptbP15508 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SptbP15508 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SptbP15508 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SptbP15508 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SptbP15508 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SptbP15508 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SptbP15508 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SptbP15508 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SptbP15508 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SptbP15508 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SptbP15508 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SptbP15508 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SptbP15508 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SptbP15508 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms