Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf1P15314 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf1P15314 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms