Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms