Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms