Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb1P12658 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb1P12658 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb1P12658 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calb1P12658 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms