Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa1P11477 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms