Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lamp1P11438 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms