Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms