Protein–RNA interactions for Protein: P10711

Tcea1, Transcription elongation factor A protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea1P10711 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcea1P10711 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms