Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nid1P10493 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms