Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
P10404 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
P10404 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
P10404 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
P10404 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
P10404 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
P10404 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
P10404 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
P10404 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
P10404 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
P10404 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
P10404 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
P10404 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
P10404 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
P10404 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
P10404 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
P10404 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
P10404 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms