Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf1P09925 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf1P09925 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms