Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr1P08046 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr1P08046 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr1P08046 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms