Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SparcP07214 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SparcP07214 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SparcP07214 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SparcP07214 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SparcP07214 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SparcP07214 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SparcP07214 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SparcP07214 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SparcP07214 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SparcP07214 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SparcP07214 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SparcP07214 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SparcP07214 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SparcP07214 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SparcP07214 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SparcP07214 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SparcP07214 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SparcP07214 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SparcP07214 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SparcP07214 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SparcP07214 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SparcP07214 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SparcP07214 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SparcP07214 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SparcP07214 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SparcP07214 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SparcP07214 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SparcP07214 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SparcP07214 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SparcP07214 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SparcP07214 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SparcP07214 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SparcP07214 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SparcP07214 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SparcP07214 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SparcP07214 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SparcP07214 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SparcP07214 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SparcP07214 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SparcP07214 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SparcP07214 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SparcP07214 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SparcP07214 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SparcP07214 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SparcP07214 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SparcP07214 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SparcP07214 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SparcP07214 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms