Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms