Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06344 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06344 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06344 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06344 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06344 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06344 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06344 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06344 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06344 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06344 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06344 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06344 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06344 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06344 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06344 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06344 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06344 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06344 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06344 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06344 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06344 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06344 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06344 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06344 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06344 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06344 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06344 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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P06344 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P06344 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06344 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06344 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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P06344 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06344 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06344 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06344 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06344 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06344 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06344 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06344 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06344 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06344 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06344 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06344 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06344 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06344 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06344 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P06344 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06344 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06344 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06344 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06344 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06344 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P06344 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06344 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06344 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06344 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06344 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06344 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06344 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06344 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06344 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06344 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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