Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgamP05555 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgamP05555 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgamP05555 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgamP05555 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgamP05555 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgamP05555 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgamP05555 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms