Protein–RNA interactions for Protein: P05524

Fgf3, Fibroblast growth factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf3P05524 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fgf3P05524 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf3P05524 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf3P05524 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf3P05524 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf3P05524 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fgf3P05524 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fgf3P05524 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf3P05524 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf3P05524 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf3P05524 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fgf3P05524 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf3P05524 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf3P05524 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf3P05524 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf3P05524 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf3P05524 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf3P05524 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf3P05524 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf3P05524 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf3P05524 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf3P05524 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fgf3P05524 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf3P05524 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf3P05524 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms