Protein–RNA interactions for Protein: P04247

Mb, Myoglobin, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MbP04247 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MbP04247 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MbP04247 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MbP04247 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MbP04247 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MbP04247 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MbP04247 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MbP04247 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MbP04247 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MbP04247 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MbP04247 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MbP04247 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MbP04247 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MbP04247 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MbP04247 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MbP04247 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MbP04247 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MbP04247 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MbP04247 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MbP04247 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MbP04247 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MbP04247 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MbP04247 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MbP04247 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MbP04247 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MbP04247 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MbP04247 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MbP04247 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MbP04247 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MbP04247 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MbP04247 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MbP04247 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MbP04247 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MbP04247 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MbP04247 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MbP04247 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MbP04247 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MbP04247 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MbP04247 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MbP04247 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MbP04247 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MbP04247 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MbP04247 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MbP04247 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MbP04247 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MbP04247 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MbP04247 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MbP04247 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MbP04247 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MbP04247 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MbP04247 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MbP04247 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MbP04247 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MbP04247 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms